La institución establece estructuras organizativas que promueven la buena gobernanza del sistema en general y promueven su efectividad y eficiencia en la recaudación y cobranza de cotizaciones, en consonancia con la reglamentación nacional y los principios administrativos establecidos en materia de seguridad social.
Las instituciones de seguridad social no solo se ocupan de recaudar las cotizaciones, sino también del registro de la información acerca de los periodos de cotización y otros asuntos relativos a las prestaciones de seguridad social.
Las Directrices de la AISS sobre la Buena Gobernanza ofrecen información adicional sobre estos aspectos. Esta información se basa en los cinco principios de la buena gobernanza, a saber, la responsabilidad, la transparencia, la previsibilidad, la participación y el dinamismo.