في إطار سعيها لتحقيق أهدافها الإستراتيجية وتقديم خدمات نوعية للمؤسسات الأعضاء، تلتزم الأمانة العامة في مبادئ الشراكة والنزاهة والانفتاح أمام التغيير والخدمات النوعية. ولضمان المساءلة والشفافية والحاكمية الجيدة، يقود الجمعية ميثاق الحاكمية الجيدة ومعايير الرقابة الداخلية. ومنذ عام 2010، بدأت الجمعية تعمل وفق نظام إدارة الجودة أيزو 9001:2008.

كبار المسؤولين في الجمعية الدولية للضمان الاجتماعي هم الرئيس ونائب الرئيس وأمين الصندوق والأمين العام.

الهيئات التشريعية في الجمعية:

تُعتبر الجمعية العمومية،  هي الجمعية التأسيسية للجمعية، والهيئة التشريعية العُليا. وفيها يتم التمثيل المباشر  لجميع الدول الأعضاء في الجمعية. تقوم الجمعية العمومية بتحديد مواد الدستور، التي تضع إطار عمل إدارة الجمعية . كما وتملك صلاحية حل الجمعية. وكقاعدة عامة، تجتمع الجمعية العمومية مرّة كل ثلاث سنوات.

يُعتبر المجلس  الهيئة الانتخابية للجمعية، ويتكون من أعضاء ممثلين لكل دولة لديها عضو فاعل واحد على الأقل، بحيث يكون لكل دولة عضو واحد ممثل لها في المجلس. وعلى وجه الخصوص، فإن المهام الرئيسية للمجلس هي انتخاب الرئيس وأمين الصندوق وأعضاء المكتب التنفيذي ولجنة المراقبة، فضلاً عن الأمين العام. بالإضافة إلى ذلك، يحدّد المجلس برنامج الأنشطة والميزانية الخاصة بالجمعية، لفترة الثلاث السنوات، ويقّرر نسب الاشتراكات. وكقاعدة عامة، يجتمع المجلس بمناسبة انعقاد كل دورة من دورات الجمعية العمومية.

يُعتبر المكتب التنفيذ ي الهيئة الإدارية العليا للجمعية، ويتألف من رئيس الجمعية وأمين الصندوق والأمين العام، وأعضاء منتخبين يمثّلون مختلف الأقاليم الجغرافية في العالم. على وجه الخصوص، فإن الوظيفة الرئيسية للمكتب هي تحديد خطة العمل والجدول الزمني والمبادئ التوجيهية التي ينبغي إتّباعها في وضع برنامج الأنشطة والميزانية للجمعية، إضافة لتحديد أولويات العمل ، ورصد وتقييم الإنجازات الفعلية، ووضع قواعد طلبات العضوية واعتماد اللوائح المالية. والوظيفة الأساسية الأخرى هي وضع هيكلية  وإطار عمل اللجان الفنيّة  اللازم لتمكينها من الاضطلاع بدورها في تنفيذ برنامج أنشطة الجمعية. ويجتمع المكتب التنفيذي مرة على الأقل كل خلال العام.

لجنة المراقبة  فهي تتفحص السجلاّت المالية للجمعية والتقرير السنوي والكشوفات المالية المقدّمة للمكتب التنفيذي من قبل أمين الصندوق، وتدقّق في الحوالات المالية لمطابقتها مع التعليمات المالية. كما وتقدّم لجنة المراقبة تقريراً للمكتب التنفيذي حول نتائج عملها ويتضمن التقرير ملاحظاتها وتوصياتها.